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集菌仪在生物制药方面的应用主要是在进行生物制样过程中，用于收集培养细胞或者病毒等。具体来说，它主要在以下领域发挥作用：

1. 用于生物制药工艺研发和实验：集菌仪可以用于细胞毒性试验、病毒吸附试验、细胞培养实验等，是生物制药研发和生产过程中不可少的重要工具。
2. 在生物样品收集和保存中应用：集菌仪可以方便快捷地收集各种生物样品，如细胞培养物、病毒等，同时它还可以进行低温保存，为生物样品的运输和保存提供便利。
3. 在疫苗生产中应用：集菌仪可以用于疫苗生产过程中的细胞培养物收集，确保疫苗的质量和安全。
4. 在血液净化产物生产中应用：集菌仪在血液透析器和过滤器等产物生产过程中，可以有效地收集血液中的有害物质和病毒，确保产物的安全和使用者的健康。

总之，集菌仪在生物制药领域的应用非常广泛，为生物制药的研发、生产、实验、保存和运输提供了重要的支持和保障。